Le site principal de Paestum s’étend sur près de 120 hectares, dont seulement 25 ont été fouillés. Les remparts se dressent encore, mesurant 4.750 mètres, épais de 5 à 7 m, et haut de 15 m. Il reste 24 de ses 28 tours.
Les plus anciens vestiges de la cité sont des tombes, au nord-ouest et au nord-est de la ville, ainsi que l’Héraion (sanctuaire d’Héra), à quelques kilomètres au nord, proche de l’embouchure de la rivière du Sele.
Les quartiers principaux étaient dès l’origine dédiés à des usages publics distincts, avec deux aires sacrées, au nord et au sud, séparées par l’agora. La partie méridionale de cette dernière est devenue le forum à l’époque romaine.
Les restes majeurs sont ceux des trois principaux temples doriques, qui remontent à la première moitié du VIe siècle avant notre ère. Ils étaient dédiés à Héra et Poséidon, bien que depuis le XVIIIe, on les désigne par erreur comme basilique, temple de Neptune et temple de Cérès.
